Герой Советского Союза.
Командир танкового батальона 30-го танкового полка 4-й (1-й гвардейской) танковой бригады 16-й армии Западного фронта, капитан.
Родился 5 апреля 1907 года в городе Хелм (Польша). Русский. В юности переехал с родителями на Херсонщину. Окончил сельскую школу. Работал трактористом.
В 1929 году призван в ряды Красной Армии. Служил в 54-м отдельном кавалерийском эскадроне 9-й кавалерийской дивизии. С сентября 1930 года по май 1931 года - помощник командира взвода и старшина эскадрона в 54-м кавалерийском полку. С мая 1932 года старшина бронеэскадрона 9-й кавалерийской дивизии.
С апреля 1934 года по сентябрь 1935 года - командир танкового взвода. В 1937 году окончил Ульяновскую бронетанковую школу. Участник советско-финляндской войны 1939 - 1940 годов. В боях Великой Отечественной войны с июня 1941 года.
16 октября 1941 года капитан А.А. Рафтопулло в бою у деревни Ильково в районе города Орёл со своим батальоном нанёс противнику большой урон в живой силе и боевой технике. Действуя из засад, танкисты наносили огневые удары по вражеским колоннам и быстро отходили на новые рубежи. Было подбито 43 вражеских танка. Будучи раненным, остался в строю.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 11 января 1942 года за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте борьбы с немецко-фашистским захватчиками и проявленные при этом мужество и героизм капитану Анатолию Анатольевичу Рафтопулло присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда" (№ 694).
21 февраля 1942 года в одном из боёв в районе города Ржев капитан А.А. Рафтопулло был снова ранен. После излечения в госпитале майор А.А. Рафтопулло был назначен на должность старшего помощника начальника отдела боевой подготовки автобронетанковых войск штаба Сталинградского фронта. В дальнейшем проходил службу командиром батальона курсантов Ульяновского гвардейского танкового училища имени В.И. Ленина.
После окончания Великой Отечественной войны, в 1945 году отважный офицер-танкист окончил Высшую офицерскую бронетанковую школу. Карьеру военного полковник А.А. Рафтопулло завершил в 1955 году в должности командира батальона курсантов Киевского танково-технического училища. Жил в Киеве. Скончался 21 апреля 1985 года.
Награжден тремя орденами Ленина, двумя орденами Красного Знамени, орденом Отечественной войны 1-й степени, орденом Красной Звезды, медалями.