Герой Советского Союза.
Командир корабля 4-го гвардейского авиационного полка 62-й авиационной дивизии авиации дальнего действия, гвардии лейтенант.
Родился 17 марта 1914 года в посёлке Дебальцево, ныне город Донецкой области в семье рабочего. Украинец. Окончил семь классов неполной средней школы и школу фабрично-заводского ученичества. Работал помощником машиниста на железной дороге.
В 1935 году призван в ряды Красной Армии. В 1937 году окончил Ворошиловградскую военную авиационную школу пилотов. Участник боёв на реке Халхин-Гол в 1939 году. В боях Великой Отечественной войны с августа 1941 года.
Принимал участие в обороне Сталинграда. Совершил 3 дневных и 66 ночных вылетов на бомбардировку войск и техники противника в районе заводской части Сталинграда, станций Гумрак, Лихая, населённых пунктов Россошка и Городище.
К январю 1943 года командир корабля 4-го гвардейского авиационного полка гвардии лейтенант А.Н. Пономаренко совершил 111 боевых вылетов на бомбардировку военных объектов в тылу противника, выброску парашютных десантов, доставку окружённым войскам боеприпасов.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 25 марта 1943 года за образцовое выполнение боевых заданий командования по уничтожению живой силы и техники противника и проявленные при этом мужество и героизм Алексею Никифоровичу Пономаренко присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда" (№ 925).
В 1948 году капитан А.Н.Пономаренко уволился в запас. Работал в учебных мастерских Украинской сельскохозяйственной академии. Жил в Киеве. Скончался 21 апреля 1989 года.
Награжден орденом Ленина, орденом Красного Знамени, двумя орденами Отечественной войны 1-й степени, медалями.