Дважды Герой Советского Союза.
Командир танковых полка и бригады 1-й танковой армии 1-го Украинского фронта.
Родился 24 ноября 1910 года в селе Жорнище (ныне Ильинецкого района Винницкой области, Украина). Украинец. Член ВКП(б)/КПСС с 1940 года.
В Красной/Советской Армии с 1930 года. В 1936 году окончил Ульяновскую бронетанковую школу, в 1939 году - бронетанковые курсы. Участник боёв на реке Халхин-Гол в 1939 году.
Во время Великой Отечественной войны с октября 1941 года в действующей армии. 69-й гвардейский танковый полк гвардии майора И.Н. Бойко отличился в ходе Житомирско-Бердичевской операции войск 1-го Украинского фронта, когда танкисты 1-й танковой армии 28 декабря 1943 года освободили от гитлеровцев город Казатин Винницкой области.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 10 января 1944 года за умелое руководство действиями, вверенного полка, личное мужество в боях за город Казатин, Ивану Никифоровичу Бойко присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда" (№ 2072).
1 февраля 1944 года И.Н. Бойко вступил в командование 64-й гвардейской танковой бригадой, с которой дошёл с боями до Победы, завершив войну в столице гитлеровской Германии - Берлине. Воины-танкисты комбрига И.Н. Бойко в составе войск 1-го Украинского фронта особо отличились в Проскуровско-Черновицкой операции, в ходе которой освободили от оккупантов города Новоселица и Черновицы (Черновцы). Приказом Верховного Главнокомандующего от 30 марта 1944 года, войскам отличившимся в освобождении города Черновицы (Черновцы), объявлена благодарность и в Москве дан салют 20 артиллерийскими залпами из 224 орудий.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 26 апреля 1944 года за успешное командование 64-й гвардейской танковой бригадой и героизм, проявленный при форсировании рек Днестр и Прут и освобождении города Черновицы (Черновцы), гвардии подполковник Иван Никифорович Бойко награждён второй медалью "Золотая Звезда".
После войны полковник И.Н. Бойко командовал танковым полком, был заместителем командиpa корпуса. В 1948 году он окончил Академические курсы при Военной академии бронетанковых и механизированных войск. С 1956 года — в запасе. Жил в Киеве. Скончался 12 мая 1975 года.
Награждён двумя орденами Ленина, тремя орденами Красного Знамени, орденом Суворова 2-й степени, орденом Богдана Хмельницкого 2-й степени, орденом Отечественной войны 1-й степени, орденом Красной Звезды, медалями, а также иностранным орденом.
В 1982 году именем Героя названа одна из улиц Киева.